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世界名画赏析之《天阶序论》(2023年5月28日,第五期)

拍老师 拍帮主的后花园 2023-10-24
大家周末好~
话说,鸽了快半年的《天阶序论》,终于毫无征兆地复更了!
为啥呢?
原因很简单啦……这个系列会用到卡罗林斯卡医学院Ben Murrell老师的图,
但之前小半年时间,Murrell老师家里喜添小公子,于是他撂挑子回家带娃去了……

现在Murrell老师休完产假,重出江湖,
于是咱们的《天阶序论》又可以继续搞下去了。

《天阶序论》的上几集请见:

另外,正如上一集所说,
在这小半年时间里,Cornelius小哥最早创建的那套天阶体系,
早就已经通膨了……下面复读一遍啊~

按照Cornelius小哥最原始的设定,以BA.2为骨架的变异株,增益最明显的十二个趋同突变热点位点分别是:
  • S:R346T/S
  • S:K356T
  • S:K444T/R
  • S:V445P
  • S:G446S
  • S:N450D
  • S:L452R/Q/M
  • S:N460K
  • S:F486S/V/L/P
  • S:F490S
  • S:R493Qrev/Q493L/V
  • S:S494P

对应的阶位概念如下:
  • BA.2恰好不含上述的任何一个突变,因此被作为了0阶的基线;
  • 包括BA.2.12.1在内的含有S:L452R/Q/M的则被视作1阶;
  • BA.2.74与BH.1被视作2阶;
  • BA.4/5、BA.2.75与BA.2.77被视作3阶;
  • BA.4.6、BF.7、BA.5.9、BA.2.75.5、BL.1、BL.2为4阶;
  • BQ.1、BU.1、BW.1、BA.2.75.2、BM.1.1、BA.2.3.20、BJ.1、BS.1为5阶;
  • BQ.1.1、BN.1、BM.1.1.1为6阶;
  • XBB与CJ.1为7阶,对应座天使;
  • XBB.4为8阶;
  • 九阶及以上暂时空缺~

可是呢,根据曹老师前段时间那篇预印本的预测(延伸阅读:《下一轮趋同演化新热点,未来的主流毒株,超长期的自信预测》),
现针对XBB.1.5骨架,市面上又冒出来10个热门的趋同突变热点位点,分别是:
  • R403S/K
  • N405K/D
  • K417Nrev/N417Y/H
  • K440Nrev/N440E/Q/T
  • Y453F/C
  • L455/F/W/S
  • F456L/C/V
  • T478R/N/Q/I
  • E484P
  • H505Yrev/Y505D/N/Q

新的老的一合计,妈耶,现在足足有22阶了……
就算减去403、405这两个因为其他原因比较难以突变的位点,也还剩20阶~



——总之,下面就请各位正式品鉴,世界名画,《天阶序论》:
↑ 以上是完整版~

解释一下:
  • XBB家族已经屠榜;
  • 瓜分前几名的,分别属于XBB.1.5*、XBB.1.16*、XBB.1.9*、XBB.2.3*和XBB.1.18*等子分支;
  • XBB家族以外的毒株,排名最高的是第38位的FK.1.1(整个BA.2.75家族的实力代表),后面还有一些其他的FK系列子分支;另外XBC.1.6系列凭借着在南澳的发挥也挤进了榜单;
  • 上述比较的基线,是昔日毒王XBB.1.5;
  • 各位想必看着榜单上的EG、FU、FE、FL这些后起之秀的新名字一头雾水吧?没关系,咱们明天写一篇《毒王族谱》,详细解释。

——请继续品鉴:
↑ 以上是只保留前60名的精简版(基线仍然是XBB.1.5)。
除了被红线叉掉的3个XBC子毒株不适用这套体系,
以及FK.1.1子分支算七阶之外,
剩下的各种XBB,几乎全是八阶~
所以干脆不标注了吧~

——请最后品鉴:
↑ 刺突蛋白点突变增益排行榜~
时过境迁,现在适应性增益最明显的,是S:F456L、S:K478R和S:Q613H。
之前当红的S:N460K早已成为普信突变,S:K444T更是直接负增益……

以上,搬运完毕。
再次祝大家周末愉快吧。



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